百邁客云 基因大數據挖掘平臺

豬研究套餐

立即咨詢

可視化分析平臺

無需編程、隨想隨做

五款RNA研究APP

五款DNA研究APP

標準化分析:可視化操作,參數自定義,無需編程即可做生信分析
個性化分析:深入解讀,無需等待溝通結果,隨想隨做

100+分析工具

覆蓋面全:數據處理、基因功能注釋、繪圖等功能一應俱全
靈活組合:小工具之間或與APP可靈活組合,適應特有分析流程

公共數據挖掘

探索數據背后的生物學價值

公共測序數據庫:一鍵下載、整合分析

33000

G測序數據

5710

個樣本數據

14504

篇研究相關文獻

275

篇影響因子10分以上文獻

43230條豬基因功能信息

功能信息涵蓋

公共數據分析思路

分析思路1

 

共表達分析中,整合大量相關公共樣本測序數據,可構建出相較于常規樣本量下可靠度更高的基因共表達網絡,從而基于該網絡進行更加準確的后續分析:a)預測目標轉錄因子的下游調控基因、目標調控網絡中的關鍵轉錄因子;b)預測ncRNA與mRNA之間的靶向關系;c)基于網絡中已知功能基因推測同網絡中其他功能未知基因功能;d) 將每個共表達模塊分別作為一個整體,計算其與各組織或各發育時間點之間的相關性,建立各組織相關或各時期相關基因表達網絡……

支撐文獻:

[1] Wisecaver JH et al. A Global Coexpression Network Approach for Connecting Genes to Specialized Metabolic Pathways in Plants. Plant Cell. 2017
[2]?Wen Z et al.Expression profiling and functional annotation of noncoding genes across 11 distinct organs in rat development.?Sci Rep.?2016

分析思路2

 

研究某一類基因的轉錄水平在不同處理下(或不同組織部位間、或不同發育時間點等)的變化規律,可整合多個類似研究中的公共測序數據來共同揭示該變化規律,使結果更加可靠。

支撐文獻:

[1] Patil G. et al. Soybean (Glycine max) SWEET gene family: insights through comparative genomics, transcriptome profiling and whole genome re-sequence analysis. BMC Genomics. 2015

[2] Matthijs M et al.Profiling of the Early Nitrogen Stress Response in the Diatom Phaeodactylum tricornutum Reveals a Novel Family of RING-Domain Transcription Factors. Plant Physiol. 2016

其他分析思路

 

1. 整合同一物種公共測序數據,構建物種完備轉錄本序列參考集,用于后續功能分析。

支撐文獻:

Iyer MK et al. The landscape of long noncoding RNAs in the human transcriptome. Nat Genet. 2015
2. mRNA-ncRNA聯合分析中,利用公共數據補充其中一種類型的RNA測序數據。

支撐文獻:

Liu X et al. MicroRNA-mRNA regulatory networking fine-tunes the porcine muscle fiber type, muscular mitochondrial respiratory and metabolic enzyme activities. BMC Genomics. 2016

生信科研學習平臺

助力提升科研效率
生物信息分析課程

研究思路解讀和培訓

資深專家講座

  • 標準版

    • 2萬元/年
    • 1000G數據包

      (折合20元/G)

    • 有參轉錄組分析平臺、小RNA測序分析平臺
    • 42款分析工具
      (7款基礎、20款生信、
      15款轉錄調控工具)
    • 分析平臺和工具支持的豬公共測序數據

      10000G

    • 43230條

      條豬基因功能信息

    • 8核CPU,32GB內存,1個節點
      1000G獨享存儲,500G共享存儲
    • 線上100+教學培訓

  • 專業版

    • 6萬元/年
    • 3000G數據包

      (折合20元/G)

    • 有參轉錄組分析平臺、小RNA測序分析平臺、重測序分析平臺、LncRNA測序分析平臺
    • 104款分析工具
      (7款基礎、20款生信、15款轉錄調控、29款基因組、12款繪圖、15款群體、6款非編碼RNA工具
    • 分析平臺和工具支持的豬公共測序數據

      29000G

    • 43230條

      條豬基因功能信息

    • 8核CPU,32GB內存,4個節點16核CPU,96GB內存,1個節點
      3000G獨享存儲,500G共享存儲
    • 線上100+教學培訓

足彩17146垫奖金 七星彩开奖300期结果 快3开奖结果走势图 七星和简单辅助 六台宝典 图库 彩图 济南配资网 江西快三号码走势图 河南体彩11选五走势图 配资网站排名是什么 10分快三是官方开奖吗 时时彩双面盘诀窍